Diversidad genética de especies silvestres y cultivadas de Rubus L. de los municipios de Pamplona y Chitagá, región Nororiental de Colombia.

Giovanni Orlando Cancino Escalante, Dámarys Sileidy Barbosa Hernández, Claudia Díaz. Carvajal

Resumen


Analizar las tasas de similitud y variabilidad genética entre las accesiones cultivadas elite y especies silvestres del genero Rubus con marcadores moleculares AFLP en fincas con cultivos comerciales de Rubus glaucus Benth, pertenecientes a cuatro asociaciones de cultivadores de mora en los municipios de Pamplona y Chitagá (Norte de Santander, Colombia). Se evaluaron individuos de 15 accesiones de R. glaucus que habían sido previamente seleccionados mediante  mecanismos de selección participativa en fincas comerciales y tres especies silvestres (R.adenotrichus, R.bogotensis y R.rosifolius). Se emplearon 3 combinaciones de cebadores de AFLPs previamente reportados como polimórficos y reproducibles para Rubus, con el propósito de analizar el patrón molecular de las plantas de cada accesión seleccionada. Se efectuó un análisis de agrupamiento y un análisis de coordenadas principales con AFLP, que permitió agrupar las diferentes accesiones por su semejanza o disimilitud. Para el análisis de agrupamiento se utilizó el índice de similitud de Dice y el algoritmo de agrupamiento jerárquico UPGMA. Se contabilizaron 194 marcadores, 34,16% de los cuales fueron polimórficos. Estos resultados, alcanzados por primera vez en la región nororiental de Colombia (Provincia de Pamplona) en Rubus, son importantes ya que representan el primer estudio sobre el  conocimiento de la diversidad genética de Rubus en la región de Pamplona. Adicionalmente se determino la huella genómica de genotipos elite de R. glaucus seleccionados por mecanismos de selección participativa, contribuyendo a los  programas de mejoramiento genético de la  mora de castilla y  al manejo sostenible de la diversidad genética en Colombia y en la región Andina.


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ART 8

Referencias


Potter D., Eriksson T., Evans R., Oh S-H., Smedmark J., Morgan D., Kerr M., Robertson K., Arsenault M., Campbell C . Rosaceae phylogeny and classification. Plant Syst Evol. 2007. 266:5-43.

JuinnYih H., Jer-Ming H .. Revision of Rubus (Rosaceae) in Taiwan. Tawania 2009.54(4): 285-310

Graham J., Woodhead M. Raspberries and blackberries: The genomics of Rubus. En: Folta K, Gardiner S (ed.). Genetics of Rosaceae, plant genetics and genomics. New York, USA. 2009:507-524.

Instituto de Ciencias Naturales, Facultad de Ciencias, Universidad Nacional de Colombia (2004 y continuamente actualizado). http://www.biovirtual.unal.edu.co marzo 2012.

Angulo RC. El Cultivo de la mora. En: Bayer CropScience S.A (ed). Frutales exóticos de clima frío. 2003:99-118.

Marulanda M., Isaza L., Ramírez AM. Identificación de la especie de Colletrotrichun responsable de la antracnosis en la mora de castilla en la región cafetera. Scientia et Thecnica . 2007.37(13): 585-590.

Evans KJ., Symon DE., Whalen MA., Hosking JR., Barker RM., Oliver JA. Systematics of the Rubus fruticosus aggregate (Rosaceae) and other exotic taxa in Australia. Aust Syst Bot. 2007 20: 187-251.

Tafur R., Toro JC., Navarrete A., Ramírez CA. Plan Frutícola Nacional: Desarrollo de la Fruticultura en Cundinamarca. Ministerio de Agricultura y Desarrollo Rural – ASOHOFRUCOL – SAG.2006.:92.

Agronet .http://www.agronet.gov.co/agronetweb/AnalisisEstadisticas/tabid/73/Default.aspx; Febrero 2012.

Santana G. Establecimiento de parcelas experimentales de mora de Castilla (Rubus glaucus Benth.) para evaluar la calidad y el rendimiento en Antioquia. Informe final convenio Corpoica.2003:60.

Marulanda M., López A., Aguilar S. Rosaceae Mora Rubus glaucus Benth. En: Perea DM, Matallana R LP, Tirado PA. (eds.). Biotecnología aplicada al mejoramiento de los cultivos de frutas tropicales. Universidad Nacional de Colombia.

Facultad de Ciencias, Departamento de Biología. Bogotá. Colombia. 2010: 391- 443.

Barrero-Meneses LS. Caracterización, evaluación y producción de material limpio de mora con alto valor agregado. Cundinamarca. Colombia. Corpoica. 2009: 84 p.

Cancino-Escalante GO., Sánchez-Montaño LR., Quevedo-García E., Díaz-Carvajal CY. Caracterización fenotípica de accesiones de especies de Rubus L. de los municipios de Pamplona y Chitagá, región nororiental de Colombia. Universitas Scientiarum. 2011. 16(3): 219-233.

Romoleroux K (1996). Rosaceae. University of Götenborg; Riksmuseum. p.1-50.

Duarte-Delgado DL., Chacón MI., Zarantes V., Barrero LS. Preliminary assessment of AFLP fingerprinting of Rubus glaucus Benth. Elite genotypes. Agronomía Colombiana. 2011.29: 5-13. (1). Universidad Nacional de Colombia Facultad de Agronomía.

Espinosa N (2011). Evaluación morfoagronómica y caracterización molecular de la colección de mora de Corpoica y materiales del agricultor. Trabajo de grado. Universidad Nacional de Colombia, Facultad de Agronomía, Bogotá, Colombia. p.101.

Rohlf FJ, (1998). NTSYSpc: Numerical Taxonomy and Multivariate Analysis System, versión 2.02g. Exeter Software, Setauket, NY.

Varma A., Padh H., Shrivastava N. Plant genomic DNA isolation: an art or a science. Biotechnol. J. 2007. 2:386 – 392.

-Marulanda M, López A, Aguilar S (2010). Rosaceae Mora Rubus glaucus Benth. Universidad Nacional de Colombia. p.391- 443.

Marulanda ML., López AM., Aguilar SB. Genetic diversity of wild and cultivated Rubus species in Colombia using AFLP and SSR markers. Crop Breeding and Applied Biotechnology. 2007. 7: 242-252.

Marulanda ML., Márquez MP. Caracterización de la diversidad genética de Rubus glaucus Benth con marcadores moleculares (RAPD). Actualidades Biológicas. 2001. 24 (74): 57-63.

Morillo A., Morillo Y., Zamorano A., Vásquez H., Muñoz JE. Caracterización molecular con microsatélites aleatorios RAM de la Colección de mora Rubus spp. Acta Agronómica .2005.54: 15 – 24.

Ballington JR., Luteyn MM., Romololeroux K., Castillo R. Rubus and vacciniaceous germplasm resources in the Andes of Ecuador. Plant Genet Resour Newsl . 1993.93: 9-15.

Amsellem L., Noyer JL., Bourgeois T., Hossaert-Mckey M. Comparison of genetic diversity of the invasive weed Rubus alceifolius Poir. (Rosaceae) in its native range and in areas of introduction, using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. Mol Ecol . 2000.9:443-455.




DOI: https://doi.org/10.24054/01204211.v1.n1.2012.51

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